建築體坐北朝南。日據時期，因開闢道路而將風神廟拆除過半，加上巷道取代河港，風神廟的地位不復當年。風神廟現有建物為民國十三年所重建，平面格局為三合院式帶軒，即三間起的正殿前帶四柱式單開間秤亭。正面的護龍山牆延伸為圍牆，向內轉圓弧後與拜亭前點金柱相接，使拜亭兼具門樓的功能，並且略有凹壽式的意味。廟內神像為府城寺廟神像藝術所罕見。風神高居殿堂之上，雍容華貴。陪侍的水神和火神，一青一紅，造型特別。於正殿神案旁，左側供奉雷公，右側供奉電母，並於兩側牆上繪有昔時位於鎮渡頭後南濠港右岸的接官亭彩繪。廟前立有兩個石亭，造型相同，但西邊為新作。