興濟宮坐北朝南，與大觀音亭為鄰，面寬三開間深三進，由三川殿、龍虎井和拜亭、正殿、以及過水廊後方的後殿所組成，與大觀音亭共同位於一高起之基座上。廟前原有寬廣的前庭，道路開闢後，前殿以階梯與道路緊臨。廟角「憨番抬厝角」泥塑，大門口的石獅及門前單龍虛柱，都極為精美。正殿前雖有拜殿，卻與前殿結為一體，室內空間顯得陰森，無形中加強了保生大帝無上的威儀。

興濟宮中的彩繪為府城名師陳壽彝之作，大門上繪秦叔寶、尉遲恭，畫中金金飾輪廓，線條突出，別具特色。建築特色→興濟宮殿宇一閩式木構磚造三開間三進式，座北朝南，由裝飾豐富的三川殿、龍虎井及拜庭、供奉保生大帝的正殿，及水廊後方的後殿組成，展現出道廟豪華、精心雕琢的特色，有別於隔壁的大觀音亭。 憨番抬厝角→三川門牆角有一對泥塑的「憨番抬厝角」，憨番身著鎧甲，單腳下跪成箭步姿，一手撐起牆頭，一手插腰，狀似輕鬆自然，十分有趣。

【石獅】門口石獅是嘉慶、道光年間製作，雕刻生動 ，享有香火，嘴裡不時還可見信徒表慰勞的糕餅，左邊雄獅腳踏彩球，威風凜凜，右邊母獅腳護幼獅，溫柔慈祥。 龍柱→門前龍柱為同志年間作品，造形生動 ，龍爪分握元寶、寶珠、葫蘆、芭蕉扇、錢幣、琴、書、劍、靈芝等八寶，柱底並有「鯉魚躍龍門」的造型。 門神彩繪為府城名師陳壽彝之作品，不同於大觀音亭的佛教護法神，這裡所畫的門神是秦叔寶與尉遲恭，畫中以金線描繪輪廓，線條突出，風格獨特。側門的三十六將官，姿態、表情各異，頗有特色。廟壁石堵雕有麒麟，左踏葫蘆、犀角、筆碇，右踩琴、棋、書畫。正殿內設有「眼科」、「內科」、「小兒科外科」三個藥籤筒及一個運籤筒，供信徒問籤之用。在正殿保生大帝的神案下，設有「下壇將軍」虎爺的鎮護廟堂。