為一磚牆木構造之閩式平房，座北朝南，由凹壽形的三川門、拜亭、龍虎井、正殿、過水廊及後殿所組成。

觀音亭中主要供祀觀音大士、十八羅漢、三寶佛、月老、大聖爺等神像。本亭建築的最大特色，便是正殿前方的拜亭採取了不同一般構架的「抱廈」形式，可以看出大觀音亭之所以稱為「亭」的原因所在。 另外，廟中的石作、木作多是幾次重修時的故物，諸如神彝的几罩、格扇、木刻、石刻等常有佳作出現；彩繪和興濟宮一樣，亦是陳壽龕的作品，可惜大部分畫作皆因鼎盛的香火而遭油燻。大觀音亭保有重要文物甚多其中尤其是明永曆年間創廟時神祉塑像最為珍貴，如觀音大士，側身金飾，極為端重莊嚴。另外廟內存有古匾、對聯多幅。

神龕前柱上由太子少保王得祿所題的「現月相珠瓔滿珞薰修三昧成摩地，湧金波寶網交羅超度重生出愛河」木牌對聯即是其中佳作之一。