創建於清乾隆二十年的妙壽宮，座北朝南，原是一座三開間兩進雨廂房式的廟宇建築，廟的右側在清同治六年丁卯(西元一八六七年)建百「金萬安」號王船室。可惜在民國六十九年庚申，國勝路開闢時，右廂房及王船室被迫拆除，民國七十四年加以修護成為今日的面貌。

儘管廟貌已變，但前殿入口一對蝙蝠石柱，不僅造型特殊，上面還刻有道光十八年丙申(西元一八三六年)水師提督王得祿敬撰的楹聯。這兩根石柱，原是安平水師五館之一的「海山館」所有，日據以後，海山館功能變異，才移入妙壽宮的。

而嘉慶十一年丙寅(西元一八七六年)為安平守城剿賊有功諸義士而立的「欽命義懷誠忠」匾，則是唯一較具古意的名匾。建築特色→妙壽宮座向是傳統建築常見的座北朝南略偏西，構造形式為承重牆加柱樑系統的混合構造，柱樑系統為南方特有的疊斗式，承重牆則為磚造再予以粉刷。

前後殿為燕尾屋脊，中間連接馬背，內為捲棚頂；三川殿係單簷重脊的三川脊。 蝙蝠柱→檐廊（步口）置有兩根花崗石柱，係難得一見的「蝙蝠柱」，花崗材質，原為海山館所有，柱上刻有蝙蝠（取諧音福）、鶴（取其長壽）及祥雲圍繞，並題有清代名將王得祿之題聯「浪靜風平水陸均沾福澤，威靈赫渥軍民盡感慈庥」。

正殿大樑彩繪金龍，拱護八卦。而門神秦叔寶、尉遲恭與側門彩繪三十六官將，別具特色。