水堀頭屬於倒風內海的3叉港，佔地利之便，船隻可直通福建，水堀頭舊港曾是主要的砂糖、鹿皮出口港口，商船在水堀頭靠岸卸貨，繁華一時，可以稱得上是麻豆的發跡地。《諸羅縣志》中除載有平埔族人為主的麻豆社外，也有漢人為主的麻豆街，漢人移民台灣之初期，大多聚居在海岸港口，而這些港口往往成為街市，麻豆街舊址即位於倒風內海三叉港邊，應是漢人遷入麻豆的最初居住處。清乾隆中葉後，河道淤塞、海岸線西移，目前僅存部分碼頭遺跡。